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化学常用软件----chemdraw

日期:2019-11-08 05:22 来源: 化学

  是一款学化学的人基本都知晓的画结构式的软件,现已更名为ChemBioDraw

  这是一款对于我们研究化学的人来说不可缺少的软件之一,但是能够完整使用它所有动能的人,我想应该很少吧?当然,笔者也是其中之一。

  所以,也为了自我学习,就写了一下这篇文章。当然,这篇文章可能无法完全涵盖chemdraw所有的功能,这点也请大家见谅(^_^;)。

  有了ChemDraw,我们就能准确的画出标题图这么好看的结构式。但是chemdraw不是免费使用的,要买正规版还是需要花点钱。虽然在中国,大家都用破解版,笔者在这里还是推荐大家尊重知识产权,能够尽量花钱买正版。如果你只是一个大学生,为了写一下作业的话,有两款免费的软件推荐,它们是MarvinSketch和ChemSketch。当然,如果是专门的研究人员,或者硕士博士的话,还是建议买一个完整版。

  笔者现在用的是ver.13。本文主要以这款进行说明探讨(2015年1月开始ChemDraw的最新版本是ver.14)。如果仅仅是画一些结构式的话,版本的更新之间的差异不是特别大。

  Open Style Sheets :因为默认的样式表画出来的结构式并不是很漂亮,所以首先选择你想投的杂志所对应的结构式。初学者的话一般推荐ACS格式。具体的在后面会介绍

  Document Setting :可以进行包括结构式的各种样式的设定。

  →Layout :在布局方面,经常在画到一半的时候,页面空余不够了。这个时候我们就可以点击Document Size→Height・Width把操作页面扩展后,确保有足够的空间供我们作图。

化学常用软件----chemdraw

  →Drawing : 在真正画图的时候经常需要调整的地方我想应该是化学键的长宽间距等等(Bonds), 下图给出了可以更改的具体的一些项目以及其代表的含义。

化学常用软件----chemdraw

  →Colors:当然背景色跟图的颜色肯定也是可以修改的,但是笔者建议白黑搭配显得更加清晰简洁,当然各有所好。

  Apply Document Setting From : 如果你想使用其他的样式设定的时候所使用的选项。 点开选择最上方的other选项的话,可以选择你自己以前设定使用过的样式。这样一来,就可以方便的把用于powerpoint、poster、word各种文件的区分开来,是特别简便的一项功能。

  该菜单主要用于复制、修改与一些图片等等的插入。当然其中还涵盖了ChemDraw自带的一些功能。

  Copy as : 把分子结构式转换成SMILE文字序列或者SLN文字(下图所示)序列,可以把这些文字复制到剪贴板用于复制粘贴。

化学常用软件----chemdraw

  Get 3D Model: 把平面结构式转换成三维模型。转换出来的模型双击后可以用Chem3D进行再次编辑。

  Insert File:用于插入外部的一些图像文件,是十分有用的一个选项。

  Show Main、General、Style Toolbar:这三项在画结构式的时候很有用,一般都需要点开显示出来。

  Show Analysis、Chemical Properties:当画完化学结构时候,用于预测化学物理性质等数据(分子mol量,分子质量分布,沸点等等)。该选项一般是必用项目。

  Show Character Map:当需要使用希腊字母等特殊文字的时候使用的选项。当然Symbol字体也可以代用,但是在这里点开的话更加一览无余,更方便查找插入。

化学常用软件----chemdraw

  Show Chemical Warnings:在画结构式时可以检查出你的原子价态是否出现问题,一旦出现问题,它会自动以红色标出提醒。

  Fixed Lengths & Angles:指定并且统一化合物键的线长,以及结合角度。基本上都是默认的已选项目,不需要刻意去选择好。

  Align, Distribute:对所画的多个化学结构式,反应式进行排列,对其。该选项尤其在做成Table或Scheme的时候特别游泳。

化学常用软件----chemdraw

  Group, Ungroup:把多个对象化合物编成一个group,也就是把自己指定的化合物全选的功能。Ungroup相对的就是解除全选。

  Join : 选定两个化合物各自的一个化学键,使这两个化学键自动成键的功能。下图给出了具体的例子。当你写一个连续反应式的时候,该功能十分实用。

化学常用软件----chemdraw

  Bring to Front, Send to Back : 调整两个重叠的化合物之间的前后关系的功能。一个个通过菜单来设定的话挺麻烦的,请记住他们的快捷键(Windows的线),这样效率就会大大提高。

化学常用软件----chemdraw

化学常用软件----chemdraw

  接下来我们就具体到实例来一起看看怎么把这些功能组合在一起使用。可能由于版本的差异,或许会有所不同,笔者所用的是Version.13.

化学常用软件----chemdraw

  3即可。另外双键的样式也有三种形式(下图右侧所示),只需要在最初画好的双键上左键点击就能调整出自己想要的双键样式。

化学常用软件----chemdraw

  ①鼠标左键双击化合物 ②用套锁或矩形工具圈住选定化合物。要同时选取多个化合物的话,按住shift键进行前述操作即可。在选取好对象后,在进行复制→粘贴工作,复制粘贴的话当然可以直接用快捷键Ctrl+C→Ctrl+V完成啦。

  Ctrl+C→Ctrl+V刚开始画的那个箭头,一个成四个。这边的话为了方便大家看的明白,所以右图中的箭头进行了拖动处理,实际上复制粘贴后也有可能是与原来的箭头完全的覆盖重叠在一起,这一点大家注意一下。

化学常用软件----chemdraw

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  Ctrl+左键拖动更加方便。当画好下图的循环式的后,如果箭头跟结构式有重叠的地方的话,可以按照③种所介绍的方法,通过拖动箭头头或尾部进行微调。

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